Program Studi Pendidikan Agama Islam atau disingkat PAI adalah salah satu dari dua program studi yang ada di Fakultas Agama Islam Universitas Islam Jakarta. Penyelenggaraan program studi ini berlandaskan SK Izin Operasional DJ.II/171/2005 dan DJ.1/139/2010. Para pendiri universitas awalnya menamakan FKIPI, dan selanjutnya menjadi Fakultas Tarbiyah, hingga saat ini menjadi Fakultas Agama Islam dengan Program Studi Pendidikan Agama Islam. Program Studi ini menyelenggarakan pendidikan agama Islam dengan tujuan menghasilkan lulusan dalam bidang pengajaran agama Islam untuk tingkat pendidikan dasar menengah dan atas dengan kualifikasi sarjana pendidikan (S1) yang unggul, profesional, terampil, dan peka terhadap lingkungan sosial-budaya dan perkembangan teknologi informasi. Lulusan Program Studi Pendidikan Agama Islam juga dibekali keterampilan berbahasa Asing seperti bahasa Inggris, bahasa Arab dan bahasa Mandarin, selain itu kewirausahaan enterpreneurship, dan pengelolaan lembaga pendidikan